在新疆申请食品经营许可证是不收费的新疆政务服务网。

新疆政务服务网以及师阿拉尔市人民政府、莎车县人民政府、温宿县人民政府等相关部门的官方网站均明确表示，食品经营许可证的核发不收取任何费用新疆政务服务网。